Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPK5

CTU2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2Q2VPK5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTU2Q2VPK5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTU2Q2VPK5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTU2Q2VPK5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTU2Q2VPK5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTU2Q2VPK5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTU2Q2VPK5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTU2Q2VPK5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTU2Q2VPK5 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTU2Q2VPK5 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTU2Q2VPK5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTU2Q2VPK5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTU2Q2VPK5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTU2Q2VPK5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTU2Q2VPK5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTU2Q2VPK5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTU2Q2VPK5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTU2Q2VPK5 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTU2Q2VPK5 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTU2Q2VPK5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTU2Q2VPK5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTU2Q2VPK5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CTU2Q2VPK5 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTU2Q2VPK5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTU2Q2VPK5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CTU2Q2VPK5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTU2Q2VPK5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTU2Q2VPK5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTU2Q2VPK5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTU2Q2VPK5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTU2Q2VPK5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTU2Q2VPK5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTU2Q2VPK5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTU2Q2VPK5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTU2Q2VPK5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTU2Q2VPK5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTU2Q2VPK5 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTU2Q2VPK5 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTU2Q2VPK5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTU2Q2VPK5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTU2Q2VPK5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTU2Q2VPK5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTU2Q2VPK5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTU2Q2VPK5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTU2Q2VPK5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTU2Q2VPK5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CTU2Q2VPK5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CTU2Q2VPK5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CTU2Q2VPK5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTU2Q2VPK5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTU2Q2VPK5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTU2Q2VPK5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTU2Q2VPK5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTU2Q2VPK5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTU2Q2VPK5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTU2Q2VPK5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTU2Q2VPK5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTU2Q2VPK5 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTU2Q2VPK5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTU2Q2VPK5 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CTU2Q2VPK5 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CTU2Q2VPK5 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CTU2Q2VPK5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTU2Q2VPK5 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTU2Q2VPK5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTU2Q2VPK5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTU2Q2VPK5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTU2Q2VPK5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTU2Q2VPK5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTU2Q2VPK5 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTU2Q2VPK5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTU2Q2VPK5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTU2Q2VPK5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTU2Q2VPK5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CTU2Q2VPK5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTU2Q2VPK5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTU2Q2VPK5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTU2Q2VPK5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTU2Q2VPK5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CTU2Q2VPK5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CTU2Q2VPK5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTU2Q2VPK5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTU2Q2VPK5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTU2Q2VPK5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CTU2Q2VPK5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CTU2Q2VPK5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTU2Q2VPK5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTU2Q2VPK5 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTU2Q2VPK5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTU2Q2VPK5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTU2Q2VPK5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTU2Q2VPK5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTU2Q2VPK5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTU2Q2VPK5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTU2Q2VPK5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTU2Q2VPK5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTU2Q2VPK5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTU2Q2VPK5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTU2Q2VPK5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTU2Q2VPK5 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms