Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q1T7F1 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q1T7F1 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q1T7F1 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q1T7F1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q1T7F1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q1T7F1 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q1T7F1 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q1T7F1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q1T7F1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q1T7F1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q1T7F1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q1T7F1 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q1T7F1 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q1T7F1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q1T7F1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q1T7F1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q1T7F1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q1T7F1 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q1T7F1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q1T7F1 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q1T7F1 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q1T7F1 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q1T7F1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q1T7F1 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q1T7F1 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q1T7F1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q1T7F1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Q1T7F1 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q1T7F1 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q1T7F1 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q1T7F1 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q1T7F1 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q1T7F1 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q1T7F1 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q1T7F1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q1T7F1 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q1T7F1 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q1T7F1 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q1T7F1 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q1T7F1 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q1T7F1 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q1T7F1 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q1T7F1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q1T7F1 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q1T7F1 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q1T7F1 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q1T7F1 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q1T7F1 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q1T7F1 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Q1T7F1 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Q1T7F1 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Q1T7F1 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Q1T7F1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Q1T7F1 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Q1T7F1 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Q1T7F1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Q1T7F1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Q1T7F1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Q1T7F1 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Q1T7F1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Q1T7F1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Q1T7F1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Q1T7F1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Q1T7F1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q1T7F1 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q1T7F1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q1T7F1 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q1T7F1 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q1T7F1 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q1T7F1 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q1T7F1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q1T7F1 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q1T7F1 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q1T7F1 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q1T7F1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q1T7F1 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q1T7F1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q1T7F1 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q1T7F1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q1T7F1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q1T7F1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q1T7F1 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q1T7F1 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q1T7F1 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q1T7F1 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q1T7F1 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q1T7F1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q1T7F1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q1T7F1 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q1T7F1 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q1T7F1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q1T7F1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q1T7F1 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q1T7F1 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q1T7F1 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q1T7F1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q1T7F1 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q1T7F1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q1T7F1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms