Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB8

LONRF1, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 1, humanhuman

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Length 773 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF1Q17RB8 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LONRF1Q17RB8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LONRF1Q17RB8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LONRF1Q17RB8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LONRF1Q17RB8 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LONRF1Q17RB8 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LONRF1Q17RB8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LONRF1Q17RB8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LONRF1Q17RB8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LONRF1Q17RB8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LONRF1Q17RB8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LONRF1Q17RB8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LONRF1Q17RB8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LONRF1Q17RB8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LONRF1Q17RB8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LONRF1Q17RB8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LONRF1Q17RB8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LONRF1Q17RB8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LONRF1Q17RB8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LONRF1Q17RB8 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LONRF1Q17RB8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LONRF1Q17RB8 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LONRF1Q17RB8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LONRF1Q17RB8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LONRF1Q17RB8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LONRF1Q17RB8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LONRF1Q17RB8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LONRF1Q17RB8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LONRF1Q17RB8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LONRF1Q17RB8 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LONRF1Q17RB8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LONRF1Q17RB8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LONRF1Q17RB8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LONRF1Q17RB8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LONRF1Q17RB8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LONRF1Q17RB8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LONRF1Q17RB8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LONRF1Q17RB8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LONRF1Q17RB8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LONRF1Q17RB8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LONRF1Q17RB8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LONRF1Q17RB8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LONRF1Q17RB8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LONRF1Q17RB8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LONRF1Q17RB8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LONRF1Q17RB8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LONRF1Q17RB8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LONRF1Q17RB8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LONRF1Q17RB8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LONRF1Q17RB8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LONRF1Q17RB8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LONRF1Q17RB8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LONRF1Q17RB8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LONRF1Q17RB8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
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