Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Length 200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDO1Q16878 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDO1Q16878 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDO1Q16878 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDO1Q16878 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDO1Q16878 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDO1Q16878 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDO1Q16878 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDO1Q16878 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDO1Q16878 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDO1Q16878 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDO1Q16878 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CDO1Q16878 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CDO1Q16878 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDO1Q16878 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDO1Q16878 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDO1Q16878 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDO1Q16878 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDO1Q16878 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDO1Q16878 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDO1Q16878 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDO1Q16878 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDO1Q16878 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDO1Q16878 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDO1Q16878 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDO1Q16878 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDO1Q16878 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDO1Q16878 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CDO1Q16878 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDO1Q16878 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDO1Q16878 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDO1Q16878 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDO1Q16878 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDO1Q16878 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDO1Q16878 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDO1Q16878 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDO1Q16878 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDO1Q16878 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDO1Q16878 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDO1Q16878 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDO1Q16878 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDO1Q16878 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDO1Q16878 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDO1Q16878 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDO1Q16878 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDO1Q16878 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDO1Q16878 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDO1Q16878 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CDO1Q16878 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CDO1Q16878 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDO1Q16878 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDO1Q16878 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDO1Q16878 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDO1Q16878 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDO1Q16878 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDO1Q16878 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDO1Q16878 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDO1Q16878 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDO1Q16878 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDO1Q16878 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CDO1Q16878 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDO1Q16878 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CDO1Q16878 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CDO1Q16878 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDO1Q16878 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CDO1Q16878 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDO1Q16878 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDO1Q16878 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDO1Q16878 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CDO1Q16878 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDO1Q16878 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CDO1Q16878 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDO1Q16878 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDO1Q16878 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CDO1Q16878 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDO1Q16878 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDO1Q16878 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDO1Q16878 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDO1Q16878 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDO1Q16878 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDO1Q16878 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CDO1Q16878 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDO1Q16878 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CDO1Q16878 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDO1Q16878 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDO1Q16878 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDO1Q16878 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CDO1Q16878 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDO1Q16878 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDO1Q16878 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDO1Q16878 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDO1Q16878 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDO1Q16878 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDO1Q16878 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CDO1Q16878 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDO1Q16878 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDO1Q16878 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDO1Q16878 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDO1Q16878 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDO1Q16878 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
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