Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTF1Q16619 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTF1Q16619 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTF1Q16619 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTF1Q16619 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTF1Q16619 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTF1Q16619 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTF1Q16619 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTF1Q16619 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTF1Q16619 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTF1Q16619 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTF1Q16619 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CTF1Q16619 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTF1Q16619 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTF1Q16619 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTF1Q16619 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTF1Q16619 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CTF1Q16619 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTF1Q16619 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTF1Q16619 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTF1Q16619 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTF1Q16619 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTF1Q16619 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTF1Q16619 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTF1Q16619 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTF1Q16619 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTF1Q16619 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTF1Q16619 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTF1Q16619 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTF1Q16619 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTF1Q16619 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTF1Q16619 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTF1Q16619 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTF1Q16619 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTF1Q16619 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTF1Q16619 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTF1Q16619 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTF1Q16619 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTF1Q16619 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CTF1Q16619 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
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CTF1Q16619 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTF1Q16619 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTF1Q16619 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTF1Q16619 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTF1Q16619 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTF1Q16619 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
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CTF1Q16619 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTF1Q16619 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTF1Q16619 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTF1Q16619 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
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CTF1Q16619 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTF1Q16619 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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CTF1Q16619 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
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CTF1Q16619 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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CTF1Q16619 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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CTF1Q16619 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTF1Q16619 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTF1Q16619 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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CTF1Q16619 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTF1Q16619 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTF1Q16619 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTF1Q16619 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTF1Q16619 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTF1Q16619 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTF1Q16619 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTF1Q16619 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTF1Q16619 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTF1Q16619 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CTF1Q16619 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CTF1Q16619 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CTF1Q16619 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTF1Q16619 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTF1Q16619 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTF1Q16619 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTF1Q16619 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTF1Q16619 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTF1Q16619 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTF1Q16619 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTF1Q16619 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTF1Q16619 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTF1Q16619 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTF1Q16619 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTF1Q16619 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTF1Q16619 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTF1Q16619 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
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