Protein–RNA interactions for Protein: Q16553

LY6E, Lymphocyte antigen 6E, humanhuman

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Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY6EQ16553 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LY6EQ16553 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LY6EQ16553 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LY6EQ16553 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LY6EQ16553 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LY6EQ16553 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LY6EQ16553 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LY6EQ16553 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LY6EQ16553 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LY6EQ16553 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LY6EQ16553 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LY6EQ16553 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LY6EQ16553 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LY6EQ16553 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LY6EQ16553 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LY6EQ16553 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LY6EQ16553 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LY6EQ16553 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LY6EQ16553 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LY6EQ16553 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LY6EQ16553 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LY6EQ16553 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LY6EQ16553 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LY6EQ16553 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LY6EQ16553 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LY6EQ16553 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LY6EQ16553 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LY6EQ16553 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LY6EQ16553 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LY6EQ16553 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LY6EQ16553 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LY6EQ16553 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LY6EQ16553 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LY6EQ16553 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LY6EQ16553 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LY6EQ16553 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LY6EQ16553 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LY6EQ16553 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LY6EQ16553 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LY6EQ16553 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LY6EQ16553 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LY6EQ16553 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LY6EQ16553 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LY6EQ16553 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LY6EQ16553 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LY6EQ16553 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LY6EQ16553 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LY6EQ16553 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LY6EQ16553 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LY6EQ16553 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LY6EQ16553 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LY6EQ16553 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LY6EQ16553 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LY6EQ16553 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LY6EQ16553 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LY6EQ16553 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LY6EQ16553 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LY6EQ16553 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LY6EQ16553 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms