Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SNCBQ16143 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNCBQ16143 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNCBQ16143 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNCBQ16143 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNCBQ16143 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNCBQ16143 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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