Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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