Protein–RNA interactions for Protein: Q15835

GRK1, Rhodopsin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRK1Q15835 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRK1Q15835 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRK1Q15835 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRK1Q15835 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRK1Q15835 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRK1Q15835 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRK1Q15835 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRK1Q15835 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRK1Q15835 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRK1Q15835 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
GRK1Q15835 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRK1Q15835 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRK1Q15835 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRK1Q15835 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRK1Q15835 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRK1Q15835 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GRK1Q15835 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRK1Q15835 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRK1Q15835 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRK1Q15835 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRK1Q15835 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRK1Q15835 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRK1Q15835 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRK1Q15835 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRK1Q15835 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRK1Q15835 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GRK1Q15835 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRK1Q15835 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRK1Q15835 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GRK1Q15835 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GRK1Q15835 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRK1Q15835 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRK1Q15835 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms