Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
NKX1-1Q15270 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NKX1-1Q15270 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NKX1-1Q15270 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NKX1-1Q15270 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NKX1-1Q15270 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NKX1-1Q15270 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NKX1-1Q15270 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NKX1-1Q15270 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NKX1-1Q15270 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NKX1-1Q15270 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NKX1-1Q15270 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NKX1-1Q15270 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NKX1-1Q15270 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NKX1-1Q15270 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
NKX1-1Q15270 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
NKX1-1Q15270 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
NKX1-1Q15270 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NKX1-1Q15270 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NKX1-1Q15270 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NKX1-1Q15270 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NKX1-1Q15270 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
NKX1-1Q15270 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NKX1-1Q15270 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NKX1-1Q15270 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NKX1-1Q15270 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NKX1-1Q15270 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NKX1-1Q15270 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NKX1-1Q15270 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NKX1-1Q15270 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
NKX1-1Q15270 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NKX1-1Q15270 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NKX1-1Q15270 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NKX1-1Q15270 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NKX1-1Q15270 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NKX1-1Q15270 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NKX1-1Q15270 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NKX1-1Q15270 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NKX1-1Q15270 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
NKX1-1Q15270 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NKX1-1Q15270 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NKX1-1Q15270 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NKX1-1Q15270 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NKX1-1Q15270 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NKX1-1Q15270 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NKX1-1Q15270 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
NKX1-1Q15270 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NKX1-1Q15270 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NKX1-1Q15270 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NKX1-1Q15270 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NKX1-1Q15270 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NKX1-1Q15270 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NKX1-1Q15270 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NKX1-1Q15270 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NKX1-1Q15270 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NKX1-1Q15270 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
NKX1-1Q15270 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NKX1-1Q15270 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NKX1-1Q15270 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NKX1-1Q15270 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NKX1-1Q15270 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NKX1-1Q15270 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
NKX1-1Q15270 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
NKX1-1Q15270 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NKX1-1Q15270 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NKX1-1Q15270 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NKX1-1Q15270 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NKX1-1Q15270 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NKX1-1Q15270 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NKX1-1Q15270 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NKX1-1Q15270 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NKX1-1Q15270 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NKX1-1Q15270 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NKX1-1Q15270 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NKX1-1Q15270 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
NKX1-1Q15270 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NKX1-1Q15270 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NKX1-1Q15270 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NKX1-1Q15270 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NKX1-1Q15270 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NKX1-1Q15270 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NKX1-1Q15270 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NKX1-1Q15270 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NKX1-1Q15270 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NKX1-1Q15270 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NKX1-1Q15270 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NKX1-1Q15270 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NKX1-1Q15270 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
NKX1-1Q15270 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NKX1-1Q15270 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NKX1-1Q15270 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
NKX1-1Q15270 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NKX1-1Q15270 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NKX1-1Q15270 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
NKX1-1Q15270 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NKX1-1Q15270 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NKX1-1Q15270 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NKX1-1Q15270 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NKX1-1Q15270 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NKX1-1Q15270 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms