Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERV3-1Q14264 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ERV3-1Q14264 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ERV3-1Q14264 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERV3-1Q14264 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERV3-1Q14264 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERV3-1Q14264 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms