Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM25Q14258 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM25Q14258 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM25Q14258 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM25Q14258 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM25Q14258 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM25Q14258 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM25Q14258 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM25Q14258 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM25Q14258 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM25Q14258 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM25Q14258 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM25Q14258 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM25Q14258 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM25Q14258 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM25Q14258 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM25Q14258 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM25Q14258 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM25Q14258 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM25Q14258 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM25Q14258 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM25Q14258 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM25Q14258 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM25Q14258 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM25Q14258 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM25Q14258 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM25Q14258 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM25Q14258 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM25Q14258 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM25Q14258 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM25Q14258 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM25Q14258 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM25Q14258 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM25Q14258 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM25Q14258 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM25Q14258 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM25Q14258 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM25Q14258 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM25Q14258 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM25Q14258 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM25Q14258 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM25Q14258 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM25Q14258 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM25Q14258 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM25Q14258 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM25Q14258 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM25Q14258 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM25Q14258 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM25Q14258 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM25Q14258 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM25Q14258 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM25Q14258 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM25Q14258 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM25Q14258 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM25Q14258 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM25Q14258 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM25Q14258 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM25Q14258 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM25Q14258 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM25Q14258 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM25Q14258 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM25Q14258 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM25Q14258 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM25Q14258 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM25Q14258 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM25Q14258 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM25Q14258 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM25Q14258 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM25Q14258 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM25Q14258 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM25Q14258 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM25Q14258 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM25Q14258 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM25Q14258 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM25Q14258 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM25Q14258 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM25Q14258 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM25Q14258 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM25Q14258 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM25Q14258 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM25Q14258 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM25Q14258 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM25Q14258 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM25Q14258 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM25Q14258 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
TRIM25Q14258 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM25Q14258 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM25Q14258 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM25Q14258 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM25Q14258 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM25Q14258 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM25Q14258 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM25Q14258 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM25Q14258 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM25Q14258 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM25Q14258 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM25Q14258 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM25Q14258 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM25Q14258 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM25Q14258 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms