Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTCH1Q13635 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTCH1Q13635 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTCH1Q13635 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTCH1Q13635 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTCH1Q13635 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
PTCH1Q13635 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTCH1Q13635 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTCH1Q13635 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTCH1Q13635 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTCH1Q13635 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTCH1Q13635 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
PTCH1Q13635 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTCH1Q13635 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTCH1Q13635 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTCH1Q13635 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTCH1Q13635 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTCH1Q13635 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PTCH1Q13635 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PTCH1Q13635 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PTCH1Q13635 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
PTCH1Q13635 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PTCH1Q13635 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PTCH1Q13635 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PTCH1Q13635 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
PTCH1Q13635 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PTCH1Q13635 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PTCH1Q13635 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PTCH1Q13635 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PTCH1Q13635 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
PTCH1Q13635 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PTCH1Q13635 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PTCH1Q13635 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PTCH1Q13635 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PTCH1Q13635 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PTCH1Q13635 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PTCH1Q13635 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PTCH1Q13635 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PTCH1Q13635 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PTCH1Q13635 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PTCH1Q13635 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PTCH1Q13635 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.45
PTCH1Q13635 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTCH1Q13635 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTCH1Q13635 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTCH1Q13635 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTCH1Q13635 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTCH1Q13635 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTCH1Q13635 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTCH1Q13635 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTCH1Q13635 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PTCH1Q13635 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PTCH1Q13635 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PTCH1Q13635 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PTCH1Q13635 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PTCH1Q13635 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTCH1Q13635 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTCH1Q13635 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTCH1Q13635 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
PTCH1Q13635 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTCH1Q13635 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTCH1Q13635 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTCH1Q13635 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTCH1Q13635 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTCH1Q13635 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTCH1Q13635 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTCH1Q13635 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTCH1Q13635 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTCH1Q13635 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTCH1Q13635 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
PTCH1Q13635 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PTCH1Q13635 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PTCH1Q13635 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PTCH1Q13635 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PTCH1Q13635 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PTCH1Q13635 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PTCH1Q13635 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PTCH1Q13635 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PTCH1Q13635 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PTCH1Q13635 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PTCH1Q13635 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PTCH1Q13635 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PTCH1Q13635 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PTCH1Q13635 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PTCH1Q13635 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
PTCH1Q13635 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTCH1Q13635 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTCH1Q13635 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTCH1Q13635 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTCH1Q13635 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTCH1Q13635 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTCH1Q13635 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTCH1Q13635 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
PTCH1Q13635 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
PTCH1Q13635 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
PTCH1Q13635 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
PTCH1Q13635 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
PTCH1Q13635 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PTCH1Q13635 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PTCH1Q13635 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
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