Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CUL3Q13618 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CUL3Q13618 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CUL3Q13618 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CUL3Q13618 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CUL3Q13618 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CUL3Q13618 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CUL3Q13618 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CUL3Q13618 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CUL3Q13618 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CUL3Q13618 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CUL3Q13618 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CUL3Q13618 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CUL3Q13618 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CUL3Q13618 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CUL3Q13618 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CUL3Q13618 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CUL3Q13618 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CUL3Q13618 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CUL3Q13618 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CUL3Q13618 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CUL3Q13618 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CUL3Q13618 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CUL3Q13618 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CUL3Q13618 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CUL3Q13618 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CUL3Q13618 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CUL3Q13618 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CUL3Q13618 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CUL3Q13618 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CUL3Q13618 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CUL3Q13618 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CUL3Q13618 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CUL3Q13618 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CUL3Q13618 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CUL3Q13618 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CUL3Q13618 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CUL3Q13618 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CUL3Q13618 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CUL3Q13618 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CUL3Q13618 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CUL3Q13618 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CUL3Q13618 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CUL3Q13618 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CUL3Q13618 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CUL3Q13618 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CUL3Q13618 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CUL3Q13618 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CUL3Q13618 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CUL3Q13618 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CUL3Q13618 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CUL3Q13618 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CUL3Q13618 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CUL3Q13618 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CUL3Q13618 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CUL3Q13618 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CUL3Q13618 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CUL3Q13618 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CUL3Q13618 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CUL3Q13618 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CUL3Q13618 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CUL3Q13618 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CUL3Q13618 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CUL3Q13618 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CUL3Q13618 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CUL3Q13618 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CUL3Q13618 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CUL3Q13618 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CUL3Q13618 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CUL3Q13618 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CUL3Q13618 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CUL3Q13618 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CUL3Q13618 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CUL3Q13618 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CUL3Q13618 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CUL3Q13618 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CUL3Q13618 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CUL3Q13618 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CUL3Q13618 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CUL3Q13618 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CUL3Q13618 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CUL3Q13618 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CUL3Q13618 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CUL3Q13618 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CUL3Q13618 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CUL3Q13618 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CUL3Q13618 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CUL3Q13618 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CUL3Q13618 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CUL3Q13618 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CUL3Q13618 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CUL3Q13618 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CUL3Q13618 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CUL3Q13618 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CUL3Q13618 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CUL3Q13618 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CUL3Q13618 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CUL3Q13618 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CUL3Q13618 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CUL3Q13618 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
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