Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATRQ13535 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATRQ13535 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ATRQ13535 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ATRQ13535 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATRQ13535 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATRQ13535 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATRQ13535 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATRQ13535 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATRQ13535 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATRQ13535 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATRQ13535 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATRQ13535 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATRQ13535 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATRQ13535 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATRQ13535 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATRQ13535 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATRQ13535 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATRQ13535 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATRQ13535 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATRQ13535 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATRQ13535 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATRQ13535 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ATRQ13535 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATRQ13535 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATRQ13535 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATRQ13535 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATRQ13535 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ATRQ13535 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATRQ13535 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATRQ13535 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATRQ13535 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATRQ13535 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATRQ13535 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATRQ13535 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ATRQ13535 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATRQ13535 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATRQ13535 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATRQ13535 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ATRQ13535 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ATRQ13535 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATRQ13535 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATRQ13535 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATRQ13535 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ATRQ13535 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATRQ13535 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATRQ13535 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ATRQ13535 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATRQ13535 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATRQ13535 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATRQ13535 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATRQ13535 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATRQ13535 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATRQ13535 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATRQ13535 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATRQ13535 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATRQ13535 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATRQ13535 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATRQ13535 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATRQ13535 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATRQ13535 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATRQ13535 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATRQ13535 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ATRQ13535 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATRQ13535 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ATRQ13535 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATRQ13535 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATRQ13535 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATRQ13535 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATRQ13535 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATRQ13535 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATRQ13535 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATRQ13535 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATRQ13535 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATRQ13535 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATRQ13535 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ATRQ13535 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ATRQ13535 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATRQ13535 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATRQ13535 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATRQ13535 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATRQ13535 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATRQ13535 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATRQ13535 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATRQ13535 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATRQ13535 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATRQ13535 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATRQ13535 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATRQ13535 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATRQ13535 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATRQ13535 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATRQ13535 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATRQ13535 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ATRQ13535 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATRQ13535 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATRQ13535 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATRQ13535 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATRQ13535 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATRQ13535 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATRQ13535 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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