Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
XRCC4Q13426 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XRCC4Q13426 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XRCC4Q13426 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XRCC4Q13426 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XRCC4Q13426 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
XRCC4Q13426 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XRCC4Q13426 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
XRCC4Q13426 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XRCC4Q13426 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XRCC4Q13426 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XRCC4Q13426 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XRCC4Q13426 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XRCC4Q13426 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
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