Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PTGDRQ13258 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PTGDRQ13258 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTGDRQ13258 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTGDRQ13258 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTGDRQ13258 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTGDRQ13258 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTGDRQ13258 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTGDRQ13258 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTGDRQ13258 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTGDRQ13258 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PTGDRQ13258 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTGDRQ13258 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PTGDRQ13258 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PTGDRQ13258 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTGDRQ13258 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTGDRQ13258 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PTGDRQ13258 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTGDRQ13258 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTGDRQ13258 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTGDRQ13258 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTGDRQ13258 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTGDRQ13258 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTGDRQ13258 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTGDRQ13258 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTGDRQ13258 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTGDRQ13258 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTGDRQ13258 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTGDRQ13258 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTGDRQ13258 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTGDRQ13258 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTGDRQ13258 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTGDRQ13258 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTGDRQ13258 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTGDRQ13258 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTGDRQ13258 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTGDRQ13258 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTGDRQ13258 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTGDRQ13258 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTGDRQ13258 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTGDRQ13258 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTGDRQ13258 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTGDRQ13258 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTGDRQ13258 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTGDRQ13258 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTGDRQ13258 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTGDRQ13258 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTGDRQ13258 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTGDRQ13258 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTGDRQ13258 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTGDRQ13258 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTGDRQ13258 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTGDRQ13258 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTGDRQ13258 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PTGDRQ13258 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PTGDRQ13258 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTGDRQ13258 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTGDRQ13258 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTGDRQ13258 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTGDRQ13258 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTGDRQ13258 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTGDRQ13258 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTGDRQ13258 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTGDRQ13258 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTGDRQ13258 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTGDRQ13258 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTGDRQ13258 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTGDRQ13258 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTGDRQ13258 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PTGDRQ13258 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTGDRQ13258 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PTGDRQ13258 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTGDRQ13258 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTGDRQ13258 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTGDRQ13258 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTGDRQ13258 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTGDRQ13258 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTGDRQ13258 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTGDRQ13258 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PTGDRQ13258 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTGDRQ13258 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PTGDRQ13258 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PTGDRQ13258 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTGDRQ13258 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTGDRQ13258 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTGDRQ13258 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PTGDRQ13258 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTGDRQ13258 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTGDRQ13258 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTGDRQ13258 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTGDRQ13258 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTGDRQ13258 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTGDRQ13258 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTGDRQ13258 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTGDRQ13258 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTGDRQ13258 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTGDRQ13258 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTGDRQ13258 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTGDRQ13258 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTGDRQ13258 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms