Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRSF5Q13243 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRSF5Q13243 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SRSF5Q13243 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRSF5Q13243 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRSF5Q13243 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRSF5Q13243 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRSF5Q13243 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRSF5Q13243 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRSF5Q13243 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRSF5Q13243 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRSF5Q13243 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRSF5Q13243 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRSF5Q13243 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRSF5Q13243 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRSF5Q13243 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRSF5Q13243 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRSF5Q13243 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRSF5Q13243 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SRSF5Q13243 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SRSF5Q13243 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SRSF5Q13243 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SRSF5Q13243 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SRSF5Q13243 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SRSF5Q13243 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SRSF5Q13243 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SRSF5Q13243 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SRSF5Q13243 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SRSF5Q13243 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SRSF5Q13243 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SRSF5Q13243 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRSF5Q13243 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRSF5Q13243 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRSF5Q13243 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRSF5Q13243 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRSF5Q13243 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRSF5Q13243 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRSF5Q13243 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRSF5Q13243 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRSF5Q13243 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRSF5Q13243 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRSF5Q13243 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRSF5Q13243 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SRSF5Q13243 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRSF5Q13243 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRSF5Q13243 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRSF5Q13243 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRSF5Q13243 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRSF5Q13243 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRSF5Q13243 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRSF5Q13243 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRSF5Q13243 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRSF5Q13243 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRSF5Q13243 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRSF5Q13243 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRSF5Q13243 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRSF5Q13243 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRSF5Q13243 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRSF5Q13243 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRSF5Q13243 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRSF5Q13243 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRSF5Q13243 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRSF5Q13243 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRSF5Q13243 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRSF5Q13243 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRSF5Q13243 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRSF5Q13243 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRSF5Q13243 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRSF5Q13243 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRSF5Q13243 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SRSF5Q13243 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRSF5Q13243 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRSF5Q13243 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRSF5Q13243 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SRSF5Q13243 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRSF5Q13243 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRSF5Q13243 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRSF5Q13243 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRSF5Q13243 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRSF5Q13243 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SRSF5Q13243 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRSF5Q13243 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRSF5Q13243 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRSF5Q13243 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRSF5Q13243 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRSF5Q13243 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SRSF5Q13243 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SRSF5Q13243 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRSF5Q13243 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SRSF5Q13243 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRSF5Q13243 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRSF5Q13243 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SRSF5Q13243 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SRSF5Q13243 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SRSF5Q13243 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SRSF5Q13243 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRSF5Q13243 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRSF5Q13243 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRSF5Q13243 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRSF5Q13243 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
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