Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA3BQ13214 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA3BQ13214 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA3BQ13214 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA3BQ13214 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA3BQ13214 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA3BQ13214 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA3BQ13214 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA3BQ13214 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA3BQ13214 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA3BQ13214 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEMA3BQ13214 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEMA3BQ13214 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEMA3BQ13214 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEMA3BQ13214 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEMA3BQ13214 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA3BQ13214 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA3BQ13214 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA3BQ13214 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA3BQ13214 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA3BQ13214 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA3BQ13214 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA3BQ13214 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA3BQ13214 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA3BQ13214 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA3BQ13214 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA3BQ13214 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA3BQ13214 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA3BQ13214 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA3BQ13214 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA3BQ13214 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA3BQ13214 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA3BQ13214 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA3BQ13214 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA3BQ13214 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA3BQ13214 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA3BQ13214 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA3BQ13214 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA3BQ13214 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA3BQ13214 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA3BQ13214 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA3BQ13214 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA3BQ13214 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA3BQ13214 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA3BQ13214 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA3BQ13214 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA3BQ13214 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA3BQ13214 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA3BQ13214 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA3BQ13214 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA3BQ13214 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA3BQ13214 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA3BQ13214 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA3BQ13214 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA3BQ13214 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3BQ13214 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3BQ13214 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3BQ13214 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3BQ13214 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3BQ13214 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3BQ13214 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3BQ13214 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3BQ13214 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3BQ13214 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3BQ13214 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3BQ13214 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3BQ13214 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3BQ13214 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA3BQ13214 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA3BQ13214 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA3BQ13214 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA3BQ13214 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA3BQ13214 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA3BQ13214 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA3BQ13214 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA3BQ13214 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA3BQ13214 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA3BQ13214 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA3BQ13214 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA3BQ13214 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA3BQ13214 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA3BQ13214 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA3BQ13214 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA3BQ13214 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3BQ13214 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3BQ13214 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3BQ13214 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3BQ13214 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3BQ13214 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3BQ13214 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3BQ13214 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3BQ13214 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3BQ13214 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3BQ13214 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3BQ13214 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3BQ13214 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3BQ13214 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3BQ13214 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA3BQ13214 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA3BQ13214 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms