Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
BNIP1Q12981 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
BNIP1Q12981 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
BNIP1Q12981 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
BNIP1Q12981 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BNIP1Q12981 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BNIP1Q12981 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BNIP1Q12981 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BNIP1Q12981 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BNIP1Q12981 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BNIP1Q12981 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BNIP1Q12981 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BNIP1Q12981 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BNIP1Q12981 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BNIP1Q12981 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
BNIP1Q12981 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BNIP1Q12981 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BNIP1Q12981 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BNIP1Q12981 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BNIP1Q12981 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BNIP1Q12981 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BNIP1Q12981 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BNIP1Q12981 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
BNIP1Q12981 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BNIP1Q12981 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
BNIP1Q12981 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BNIP1Q12981 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BNIP1Q12981 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BNIP1Q12981 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BNIP1Q12981 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BNIP1Q12981 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BNIP1Q12981 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BNIP1Q12981 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
BNIP1Q12981 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
BNIP1Q12981 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
BNIP1Q12981 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
BNIP1Q12981 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
BNIP1Q12981 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BNIP1Q12981 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BNIP1Q12981 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BNIP1Q12981 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BNIP1Q12981 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BNIP1Q12981 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BNIP1Q12981 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BNIP1Q12981 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BNIP1Q12981 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BNIP1Q12981 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BNIP1Q12981 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BNIP1Q12981 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BNIP1Q12981 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
BNIP1Q12981 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BNIP1Q12981 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BNIP1Q12981 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
BNIP1Q12981 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BNIP1Q12981 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BNIP1Q12981 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BNIP1Q12981 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BNIP1Q12981 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BNIP1Q12981 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BNIP1Q12981 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BNIP1Q12981 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BNIP1Q12981 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BNIP1Q12981 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BNIP1Q12981 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms