Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXF1Q12946 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
FOXF1Q12946 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FOXF1Q12946 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FOXF1Q12946 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
FOXF1Q12946 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
FOXF1Q12946 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FOXF1Q12946 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
FOXF1Q12946 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FOXF1Q12946 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms