Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSRP1Q08945 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSRP1Q08945 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSRP1Q08945 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSRP1Q08945 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSRP1Q08945 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSRP1Q08945 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SSRP1Q08945 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SSRP1Q08945 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SSRP1Q08945 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SSRP1Q08945 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SSRP1Q08945 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SSRP1Q08945 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSRP1Q08945 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSRP1Q08945 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSRP1Q08945 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSRP1Q08945 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSRP1Q08945 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSRP1Q08945 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SSRP1Q08945 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSRP1Q08945 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSRP1Q08945 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSRP1Q08945 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSRP1Q08945 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSRP1Q08945 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSRP1Q08945 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSRP1Q08945 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSRP1Q08945 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSRP1Q08945 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSRP1Q08945 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSRP1Q08945 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SSRP1Q08945 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SSRP1Q08945 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SSRP1Q08945 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SSRP1Q08945 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SSRP1Q08945 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SSRP1Q08945 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SSRP1Q08945 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SSRP1Q08945 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SSRP1Q08945 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SSRP1Q08945 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SSRP1Q08945 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SSRP1Q08945 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SSRP1Q08945 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SSRP1Q08945 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SSRP1Q08945 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SSRP1Q08945 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SSRP1Q08945 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SSRP1Q08945 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SSRP1Q08945 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SSRP1Q08945 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SSRP1Q08945 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SSRP1Q08945 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SSRP1Q08945 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SSRP1Q08945 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SSRP1Q08945 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SSRP1Q08945 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SSRP1Q08945 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SSRP1Q08945 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SSRP1Q08945 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SSRP1Q08945 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SSRP1Q08945 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SSRP1Q08945 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SSRP1Q08945 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SSRP1Q08945 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SSRP1Q08945 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SSRP1Q08945 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SSRP1Q08945 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SSRP1Q08945 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SSRP1Q08945 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SSRP1Q08945 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SSRP1Q08945 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SSRP1Q08945 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SSRP1Q08945 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SSRP1Q08945 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SSRP1Q08945 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SSRP1Q08945 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SSRP1Q08945 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SSRP1Q08945 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SSRP1Q08945 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SSRP1Q08945 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SSRP1Q08945 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SSRP1Q08945 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SSRP1Q08945 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SSRP1Q08945 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SSRP1Q08945 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SSRP1Q08945 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SSRP1Q08945 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SSRP1Q08945 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SSRP1Q08945 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SSRP1Q08945 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SSRP1Q08945 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SSRP1Q08945 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SSRP1Q08945 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SSRP1Q08945 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SSRP1Q08945 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SSRP1Q08945 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SSRP1Q08945 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SSRP1Q08945 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SSRP1Q08945 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms