Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CYP4F3Q08477 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYP4F3Q08477 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYP4F3Q08477 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYP4F3Q08477 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYP4F3Q08477 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYP4F3Q08477 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CYP4F3Q08477 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYP4F3Q08477 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYP4F3Q08477 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYP4F3Q08477 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYP4F3Q08477 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYP4F3Q08477 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYP4F3Q08477 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYP4F3Q08477 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYP4F3Q08477 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYP4F3Q08477 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYP4F3Q08477 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CYP4F3Q08477 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYP4F3Q08477 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYP4F3Q08477 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYP4F3Q08477 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYP4F3Q08477 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYP4F3Q08477 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYP4F3Q08477 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYP4F3Q08477 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CYP4F3Q08477 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CYP4F3Q08477 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYP4F3Q08477 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYP4F3Q08477 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYP4F3Q08477 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYP4F3Q08477 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CYP4F3Q08477 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CYP4F3Q08477 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CYP4F3Q08477 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CYP4F3Q08477 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CYP4F3Q08477 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms