Protein–RNA interactions for Protein: Q08043

ACTN3, Alpha-actinin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN3Q08043 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTN3Q08043 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTN3Q08043 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTN3Q08043 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTN3Q08043 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTN3Q08043 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTN3Q08043 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTN3Q08043 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTN3Q08043 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTN3Q08043 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTN3Q08043 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ACTN3Q08043 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ACTN3Q08043 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
ACTN3Q08043 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTN3Q08043 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTN3Q08043 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTN3Q08043 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTN3Q08043 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTN3Q08043 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTN3Q08043 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTN3Q08043 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTN3Q08043 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTN3Q08043 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTN3Q08043 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTN3Q08043 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTN3Q08043 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTN3Q08043 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTN3Q08043 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTN3Q08043 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTN3Q08043 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTN3Q08043 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTN3Q08043 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTN3Q08043 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTN3Q08043 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTN3Q08043 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTN3Q08043 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTN3Q08043 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTN3Q08043 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTN3Q08043 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTN3Q08043 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTN3Q08043 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTN3Q08043 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTN3Q08043 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTN3Q08043 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTN3Q08043 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTN3Q08043 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACTN3Q08043 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACTN3Q08043 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACTN3Q08043 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACTN3Q08043 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACTN3Q08043 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACTN3Q08043 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACTN3Q08043 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACTN3Q08043 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ACTN3Q08043 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ACTN3Q08043 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACTN3Q08043 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACTN3Q08043 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACTN3Q08043 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACTN3Q08043 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACTN3Q08043 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACTN3Q08043 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTN3Q08043 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTN3Q08043 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTN3Q08043 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTN3Q08043 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTN3Q08043 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTN3Q08043 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTN3Q08043 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTN3Q08043 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTN3Q08043 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTN3Q08043 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTN3Q08043 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTN3Q08043 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTN3Q08043 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTN3Q08043 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTN3Q08043 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTN3Q08043 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTN3Q08043 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTN3Q08043 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTN3Q08043 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTN3Q08043 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTN3Q08043 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTN3Q08043 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTN3Q08043 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTN3Q08043 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTN3Q08043 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTN3Q08043 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTN3Q08043 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTN3Q08043 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTN3Q08043 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTN3Q08043 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms