Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CXCL9Q07325 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CXCL9Q07325 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CXCL9Q07325 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CXCL9Q07325 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CXCL9Q07325 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CXCL9Q07325 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CXCL9Q07325 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CXCL9Q07325 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CXCL9Q07325 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CXCL9Q07325 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CXCL9Q07325 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CXCL9Q07325 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CXCL9Q07325 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CXCL9Q07325 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CXCL9Q07325 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CXCL9Q07325 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CXCL9Q07325 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CXCL9Q07325 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CXCL9Q07325 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CXCL9Q07325 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CXCL9Q07325 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CXCL9Q07325 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CXCL9Q07325 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CXCL9Q07325 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CXCL9Q07325 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CXCL9Q07325 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CXCL9Q07325 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CXCL9Q07325 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CXCL9Q07325 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CXCL9Q07325 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CXCL9Q07325 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CXCL9Q07325 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CXCL9Q07325 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CXCL9Q07325 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CXCL9Q07325 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CXCL9Q07325 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CXCL9Q07325 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CXCL9Q07325 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CXCL9Q07325 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CXCL9Q07325 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CXCL9Q07325 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CXCL9Q07325 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CXCL9Q07325 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CXCL9Q07325 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CXCL9Q07325 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CXCL9Q07325 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CXCL9Q07325 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CXCL9Q07325 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CXCL9Q07325 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CXCL9Q07325 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CXCL9Q07325 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CXCL9Q07325 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CXCL9Q07325 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CXCL9Q07325 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CXCL9Q07325 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CXCL9Q07325 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CXCL9Q07325 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CXCL9Q07325 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CXCL9Q07325 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CXCL9Q07325 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CXCL9Q07325 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CXCL9Q07325 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CXCL9Q07325 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CXCL9Q07325 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CXCL9Q07325 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CXCL9Q07325 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CXCL9Q07325 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CXCL9Q07325 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CXCL9Q07325 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CXCL9Q07325 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CXCL9Q07325 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CXCL9Q07325 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CXCL9Q07325 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CXCL9Q07325 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CXCL9Q07325 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CXCL9Q07325 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CXCL9Q07325 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CXCL9Q07325 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CXCL9Q07325 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CXCL9Q07325 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CXCL9Q07325 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CXCL9Q07325 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CXCL9Q07325 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CXCL9Q07325 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CXCL9Q07325 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CXCL9Q07325 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CXCL9Q07325 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CXCL9Q07325 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CXCL9Q07325 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CXCL9Q07325 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CXCL9Q07325 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CXCL9Q07325 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CXCL9Q07325 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CXCL9Q07325 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CXCL9Q07325 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CXCL9Q07325 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CXCL9Q07325 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CXCL9Q07325 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CXCL9Q07325 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms