Protein–RNA interactions for Protein: Q05048

CSTF1, Cleavage stimulation factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF1Q05048 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSTF1Q05048 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSTF1Q05048 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSTF1Q05048 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSTF1Q05048 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSTF1Q05048 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSTF1Q05048 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CSTF1Q05048 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSTF1Q05048 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSTF1Q05048 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSTF1Q05048 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSTF1Q05048 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSTF1Q05048 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSTF1Q05048 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSTF1Q05048 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CSTF1Q05048 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSTF1Q05048 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSTF1Q05048 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSTF1Q05048 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSTF1Q05048 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSTF1Q05048 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSTF1Q05048 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSTF1Q05048 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSTF1Q05048 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CSTF1Q05048 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CSTF1Q05048 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSTF1Q05048 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSTF1Q05048 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSTF1Q05048 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSTF1Q05048 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSTF1Q05048 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSTF1Q05048 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSTF1Q05048 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSTF1Q05048 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSTF1Q05048 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSTF1Q05048 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSTF1Q05048 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSTF1Q05048 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CSTF1Q05048 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSTF1Q05048 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSTF1Q05048 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSTF1Q05048 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSTF1Q05048 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSTF1Q05048 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSTF1Q05048 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSTF1Q05048 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSTF1Q05048 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSTF1Q05048 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CSTF1Q05048 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSTF1Q05048 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSTF1Q05048 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSTF1Q05048 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSTF1Q05048 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSTF1Q05048 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSTF1Q05048 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSTF1Q05048 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSTF1Q05048 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSTF1Q05048 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSTF1Q05048 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSTF1Q05048 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSTF1Q05048 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSTF1Q05048 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSTF1Q05048 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSTF1Q05048 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSTF1Q05048 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSTF1Q05048 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSTF1Q05048 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSTF1Q05048 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSTF1Q05048 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSTF1Q05048 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSTF1Q05048 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CSTF1Q05048 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSTF1Q05048 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CSTF1Q05048 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CSTF1Q05048 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CSTF1Q05048 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSTF1Q05048 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSTF1Q05048 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSTF1Q05048 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSTF1Q05048 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSTF1Q05048 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSTF1Q05048 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSTF1Q05048 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSTF1Q05048 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CSTF1Q05048 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSTF1Q05048 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSTF1Q05048 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSTF1Q05048 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSTF1Q05048 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CSTF1Q05048 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSTF1Q05048 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSTF1Q05048 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSTF1Q05048 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSTF1Q05048 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSTF1Q05048 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CSTF1Q05048 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CSTF1Q05048 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CSTF1Q05048 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSTF1Q05048 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSTF1Q05048 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms