Protein–RNA interactions for Protein: Q04695

KRT17, Keratin, type I cytoskeletal 17, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT17Q04695 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT17Q04695 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT17Q04695 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT17Q04695 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT17Q04695 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT17Q04695 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT17Q04695 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT17Q04695 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT17Q04695 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT17Q04695 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT17Q04695 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT17Q04695 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT17Q04695 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT17Q04695 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT17Q04695 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT17Q04695 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT17Q04695 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT17Q04695 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT17Q04695 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT17Q04695 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT17Q04695 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT17Q04695 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT17Q04695 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT17Q04695 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT17Q04695 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT17Q04695 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT17Q04695 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT17Q04695 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT17Q04695 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT17Q04695 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT17Q04695 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT17Q04695 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT17Q04695 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT17Q04695 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT17Q04695 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT17Q04695 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT17Q04695 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT17Q04695 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT17Q04695 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT17Q04695 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT17Q04695 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT17Q04695 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT17Q04695 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.35
KRT17Q04695 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT17Q04695 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT17Q04695 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT17Q04695 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT17Q04695 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT17Q04695 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT17Q04695 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT17Q04695 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT17Q04695 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT17Q04695 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT17Q04695 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT17Q04695 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT17Q04695 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT17Q04695 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT17Q04695 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT17Q04695 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT17Q04695 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT17Q04695 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT17Q04695 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT17Q04695 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT17Q04695 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT17Q04695 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT17Q04695 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT17Q04695 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT17Q04695 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT17Q04695 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT17Q04695 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT17Q04695 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT17Q04695 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT17Q04695 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT17Q04695 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT17Q04695 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT17Q04695 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT17Q04695 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT17Q04695 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT17Q04695 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT17Q04695 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT17Q04695 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT17Q04695 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT17Q04695 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT17Q04695 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT17Q04695 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT17Q04695 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT17Q04695 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT17Q04695 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT17Q04695 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT17Q04695 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT17Q04695 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT17Q04695 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT17Q04695 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT17Q04695 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT17Q04695 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT17Q04695 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT17Q04695 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT17Q04695 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT17Q04695 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT17Q04695 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms