Protein–RNA interactions for Protein: Q02978

SLC25A11, Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A11Q02978 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC25A11Q02978 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC25A11Q02978 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC25A11Q02978 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC25A11Q02978 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC25A11Q02978 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC25A11Q02978 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC25A11Q02978 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC25A11Q02978 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC25A11Q02978 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC25A11Q02978 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC25A11Q02978 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC25A11Q02978 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC25A11Q02978 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC25A11Q02978 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC25A11Q02978 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC25A11Q02978 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC25A11Q02978 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC25A11Q02978 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC25A11Q02978 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC25A11Q02978 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC25A11Q02978 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC25A11Q02978 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC25A11Q02978 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC25A11Q02978 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC25A11Q02978 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC25A11Q02978 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC25A11Q02978 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC25A11Q02978 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC25A11Q02978 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC25A11Q02978 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC25A11Q02978 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC25A11Q02978 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC25A11Q02978 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC25A11Q02978 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC25A11Q02978 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC25A11Q02978 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC25A11Q02978 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC25A11Q02978 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC25A11Q02978 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC25A11Q02978 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC25A11Q02978 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC25A11Q02978 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC25A11Q02978 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC25A11Q02978 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC25A11Q02978 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC25A11Q02978 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC25A11Q02978 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC25A11Q02978 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC25A11Q02978 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC25A11Q02978 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC25A11Q02978 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC25A11Q02978 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC25A11Q02978 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC25A11Q02978 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC25A11Q02978 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC25A11Q02978 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC25A11Q02978 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC25A11Q02978 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC25A11Q02978 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC25A11Q02978 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC25A11Q02978 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC25A11Q02978 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC25A11Q02978 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLC25A11Q02978 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLC25A11Q02978 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC25A11Q02978 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC25A11Q02978 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC25A11Q02978 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC25A11Q02978 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC25A11Q02978 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC25A11Q02978 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC25A11Q02978 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC25A11Q02978 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC25A11Q02978 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC25A11Q02978 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC25A11Q02978 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC25A11Q02978 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC25A11Q02978 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC25A11Q02978 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC25A11Q02978 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC25A11Q02978 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC25A11Q02978 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC25A11Q02978 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC25A11Q02978 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC25A11Q02978 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC25A11Q02978 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC25A11Q02978 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC25A11Q02978 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC25A11Q02978 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC25A11Q02978 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC25A11Q02978 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC25A11Q02978 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC25A11Q02978 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC25A11Q02978 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC25A11Q02978 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC25A11Q02978 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC25A11Q02978 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC25A11Q02978 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC25A11Q02978 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms