Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CDR2Q01850 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDR2Q01850 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDR2Q01850 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDR2Q01850 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDR2Q01850 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDR2Q01850 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDR2Q01850 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDR2Q01850 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDR2Q01850 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDR2Q01850 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CDR2Q01850 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDR2Q01850 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDR2Q01850 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDR2Q01850 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDR2Q01850 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDR2Q01850 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CDR2Q01850 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDR2Q01850 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDR2Q01850 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDR2Q01850 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDR2Q01850 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDR2Q01850 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDR2Q01850 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDR2Q01850 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDR2Q01850 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDR2Q01850 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CDR2Q01850 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDR2Q01850 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDR2Q01850 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDR2Q01850 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CDR2Q01850 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDR2Q01850 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDR2Q01850 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDR2Q01850 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDR2Q01850 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CDR2Q01850 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDR2Q01850 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDR2Q01850 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDR2Q01850 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDR2Q01850 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDR2Q01850 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDR2Q01850 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDR2Q01850 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDR2Q01850 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDR2Q01850 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDR2Q01850 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDR2Q01850 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDR2Q01850 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDR2Q01850 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDR2Q01850 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDR2Q01850 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDR2Q01850 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDR2Q01850 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDR2Q01850 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDR2Q01850 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDR2Q01850 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDR2Q01850 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDR2Q01850 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDR2Q01850 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDR2Q01850 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDR2Q01850 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDR2Q01850 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDR2Q01850 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDR2Q01850 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CDR2Q01850 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDR2Q01850 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDR2Q01850 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDR2Q01850 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDR2Q01850 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDR2Q01850 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CDR2Q01850 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDR2Q01850 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDR2Q01850 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CDR2Q01850 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CDR2Q01850 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CDR2Q01850 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDR2Q01850 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CDR2Q01850 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CDR2Q01850 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CDR2Q01850 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDR2Q01850 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDR2Q01850 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDR2Q01850 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDR2Q01850 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDR2Q01850 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDR2Q01850 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDR2Q01850 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDR2Q01850 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDR2Q01850 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDR2Q01850 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDR2Q01850 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDR2Q01850 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDR2Q01850 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDR2Q01850 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDR2Q01850 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDR2Q01850 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDR2Q01850 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDR2Q01850 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDR2Q01850 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms