Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCN7AQ01118 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCN7AQ01118 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCN7AQ01118 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCN7AQ01118 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCN7AQ01118 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCN7AQ01118 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCN7AQ01118 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCN7AQ01118 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCN7AQ01118 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCN7AQ01118 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCN7AQ01118 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCN7AQ01118 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCN7AQ01118 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCN7AQ01118 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCN7AQ01118 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCN7AQ01118 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SCN7AQ01118 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SCN7AQ01118 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCN7AQ01118 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCN7AQ01118 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCN7AQ01118 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCN7AQ01118 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCN7AQ01118 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCN7AQ01118 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCN7AQ01118 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCN7AQ01118 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCN7AQ01118 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCN7AQ01118 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCN7AQ01118 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCN7AQ01118 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCN7AQ01118 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCN7AQ01118 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCN7AQ01118 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCN7AQ01118 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SCN7AQ01118 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCN7AQ01118 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCN7AQ01118 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCN7AQ01118 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCN7AQ01118 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCN7AQ01118 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCN7AQ01118 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCN7AQ01118 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCN7AQ01118 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCN7AQ01118 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCN7AQ01118 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SCN7AQ01118 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SCN7AQ01118 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCN7AQ01118 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCN7AQ01118 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCN7AQ01118 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCN7AQ01118 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCN7AQ01118 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCN7AQ01118 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCN7AQ01118 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCN7AQ01118 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCN7AQ01118 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCN7AQ01118 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SCN7AQ01118 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCN7AQ01118 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCN7AQ01118 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCN7AQ01118 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCN7AQ01118 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCN7AQ01118 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SCN7AQ01118 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCN7AQ01118 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SCN7AQ01118 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCN7AQ01118 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCN7AQ01118 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCN7AQ01118 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCN7AQ01118 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCN7AQ01118 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCN7AQ01118 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SCN7AQ01118 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SCN7AQ01118 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCN7AQ01118 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCN7AQ01118 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCN7AQ01118 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCN7AQ01118 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCN7AQ01118 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SCN7AQ01118 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCN7AQ01118 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCN7AQ01118 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCN7AQ01118 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SCN7AQ01118 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCN7AQ01118 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCN7AQ01118 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCN7AQ01118 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SCN7AQ01118 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCN7AQ01118 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCN7AQ01118 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCN7AQ01118 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCN7AQ01118 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SCN7AQ01118 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCN7AQ01118 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SCN7AQ01118 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SCN7AQ01118 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCN7AQ01118 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCN7AQ01118 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCN7AQ01118 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms