Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
HSF1Q00613 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HSF1Q00613 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HSF1Q00613 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HSF1Q00613 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HSF1Q00613 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HSF1Q00613 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HSF1Q00613 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HSF1Q00613 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HSF1Q00613 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HSF1Q00613 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HSF1Q00613 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HSF1Q00613 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HSF1Q00613 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HSF1Q00613 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HSF1Q00613 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HSF1Q00613 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HSF1Q00613 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HSF1Q00613 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HSF1Q00613 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HSF1Q00613 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HSF1Q00613 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HSF1Q00613 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
HSF1Q00613 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HSF1Q00613 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HSF1Q00613 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HSF1Q00613 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HSF1Q00613 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HSF1Q00613 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HSF1Q00613 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HSF1Q00613 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HSF1Q00613 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HSF1Q00613 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HSF1Q00613 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HSF1Q00613 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HSF1Q00613 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HSF1Q00613 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HSF1Q00613 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HSF1Q00613 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HSF1Q00613 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HSF1Q00613 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HSF1Q00613 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HSF1Q00613 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HSF1Q00613 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HSF1Q00613 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HSF1Q00613 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HSF1Q00613 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HSF1Q00613 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HSF1Q00613 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HSF1Q00613 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HSF1Q00613 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HSF1Q00613 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HSF1Q00613 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HSF1Q00613 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HSF1Q00613 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HSF1Q00613 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HSF1Q00613 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HSF1Q00613 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HSF1Q00613 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HSF1Q00613 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HSF1Q00613 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HSF1Q00613 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HSF1Q00613 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HSF1Q00613 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HSF1Q00613 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HSF1Q00613 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HSF1Q00613 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HSF1Q00613 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HSF1Q00613 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HSF1Q00613 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HSF1Q00613 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HSF1Q00613 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HSF1Q00613 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HSF1Q00613 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HSF1Q00613 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HSF1Q00613 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HSF1Q00613 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HSF1Q00613 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HSF1Q00613 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
HSF1Q00613 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HSF1Q00613 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HSF1Q00613 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HSF1Q00613 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
HSF1Q00613 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HSF1Q00613 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HSF1Q00613 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HSF1Q00613 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HSF1Q00613 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HSF1Q00613 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HSF1Q00613 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HSF1Q00613 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HSF1Q00613 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HSF1Q00613 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HSF1Q00613 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HSF1Q00613 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HSF1Q00613 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HSF1Q00613 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HSF1Q00613 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HSF1Q00613 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HSF1Q00613 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms