Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBB4BP68371 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBB4BP68371 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBB4BP68371 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBB4BP68371 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBB4BP68371 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBB4BP68371 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB4BP68371 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB4BP68371 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB4BP68371 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB4BP68371 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB4BP68371 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB4BP68371 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB4BP68371 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB4BP68371 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB4BP68371 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB4BP68371 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB4BP68371 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB4BP68371 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB4BP68371 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB4BP68371 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB4BP68371 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBB4BP68371 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBB4BP68371 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBB4BP68371 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBB4BP68371 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBB4BP68371 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBB4BP68371 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBB4BP68371 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBB4BP68371 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBB4BP68371 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBB4BP68371 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBB4BP68371 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBB4BP68371 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBB4BP68371 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBB4BP68371 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBB4BP68371 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBB4BP68371 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBB4BP68371 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBB4BP68371 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBB4BP68371 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBB4BP68371 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBB4BP68371 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBB4BP68371 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBB4BP68371 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms