Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACTA1P68133 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACTA1P68133 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACTA1P68133 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACTA1P68133 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACTA1P68133 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACTA1P68133 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ACTA1P68133 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ACTA1P68133 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ACTA1P68133 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACTA1P68133 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACTA1P68133 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACTA1P68133 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACTA1P68133 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACTA1P68133 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms