Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SKP1P63208 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKP1P63208 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKP1P63208 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKP1P63208 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKP1P63208 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKP1P63208 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKP1P63208 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKP1P63208 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKP1P63208 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKP1P63208 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKP1P63208 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKP1P63208 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKP1P63208 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKP1P63208 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKP1P63208 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKP1P63208 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKP1P63208 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKP1P63208 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKP1P63208 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SKP1P63208 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKP1P63208 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SKP1P63208 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SKP1P63208 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKP1P63208 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKP1P63208 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKP1P63208 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKP1P63208 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKP1P63208 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKP1P63208 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKP1P63208 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKP1P63208 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKP1P63208 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKP1P63208 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKP1P63208 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKP1P63208 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKP1P63208 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKP1P63208 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKP1P63208 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKP1P63208 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKP1P63208 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKP1P63208 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SKP1P63208 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKP1P63208 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKP1P63208 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKP1P63208 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKP1P63208 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKP1P63208 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKP1P63208 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKP1P63208 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKP1P63208 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKP1P63208 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKP1P63208 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKP1P63208 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKP1P63208 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKP1P63208 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SKP1P63208 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKP1P63208 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
SKP1P63208 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
SKP1P63208 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SKP1P63208 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SKP1P63208 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SKP1P63208 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SKP1P63208 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SKP1P63208 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SKP1P63208 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SKP1P63208 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SKP1P63208 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SKP1P63208 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SKP1P63208 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SKP1P63208 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SKP1P63208 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SKP1P63208 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SKP1P63208 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SKP1P63208 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SKP1P63208 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SKP1P63208 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKP1P63208 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKP1P63208 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKP1P63208 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SKP1P63208 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKP1P63208 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKP1P63208 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKP1P63208 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKP1P63208 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKP1P63208 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKP1P63208 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKP1P63208 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKP1P63208 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKP1P63208 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKP1P63208 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKP1P63208 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKP1P63208 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKP1P63208 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKP1P63208 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKP1P63208 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKP1P63208 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKP1P63208 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKP1P63208 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKP1P63208 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms