Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms