Protein–RNA interactions for Protein: P54840

GYS2, Glycogen [starch] synthase, liver, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GYS2P54840 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GYS2P54840 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GYS2P54840 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GYS2P54840 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GYS2P54840 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GYS2P54840 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GYS2P54840 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GYS2P54840 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GYS2P54840 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GYS2P54840 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GYS2P54840 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GYS2P54840 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GYS2P54840 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GYS2P54840 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GYS2P54840 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GYS2P54840 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GYS2P54840 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GYS2P54840 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GYS2P54840 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GYS2P54840 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GYS2P54840 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GYS2P54840 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GYS2P54840 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GYS2P54840 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GYS2P54840 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GYS2P54840 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GYS2P54840 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GYS2P54840 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GYS2P54840 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GYS2P54840 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GYS2P54840 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GYS2P54840 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GYS2P54840 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GYS2P54840 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GYS2P54840 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GYS2P54840 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GYS2P54840 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GYS2P54840 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GYS2P54840 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GYS2P54840 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GYS2P54840 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GYS2P54840 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GYS2P54840 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GYS2P54840 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GYS2P54840 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GYS2P54840 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GYS2P54840 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GYS2P54840 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GYS2P54840 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GYS2P54840 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GYS2P54840 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GYS2P54840 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GYS2P54840 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GYS2P54840 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GYS2P54840 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GYS2P54840 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GYS2P54840 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GYS2P54840 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GYS2P54840 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GYS2P54840 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GYS2P54840 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GYS2P54840 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GYS2P54840 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GYS2P54840 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GYS2P54840 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GYS2P54840 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GYS2P54840 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GYS2P54840 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GYS2P54840 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GYS2P54840 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GYS2P54840 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GYS2P54840 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GYS2P54840 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GYS2P54840 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GYS2P54840 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GYS2P54840 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GYS2P54840 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GYS2P54840 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GYS2P54840 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GYS2P54840 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GYS2P54840 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GYS2P54840 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GYS2P54840 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GYS2P54840 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GYS2P54840 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GYS2P54840 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GYS2P54840 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GYS2P54840 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GYS2P54840 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GYS2P54840 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GYS2P54840 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GYS2P54840 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GYS2P54840 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GYS2P54840 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GYS2P54840 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GYS2P54840 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GYS2P54840 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GYS2P54840 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GYS2P54840 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GYS2P54840 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms