Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EPHB4P54760 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EPHB4P54760 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
EPHB4P54760 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EPHB4P54760 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
EPHB4P54760 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EPHB4P54760 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EPHB4P54760 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EPHB4P54760 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EPHB4P54760 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EPHB4P54760 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EPHB4P54760 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EPHB4P54760 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EPHB4P54760 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EPHB4P54760 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EPHB4P54760 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EPHB4P54760 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EPHB4P54760 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EPHB4P54760 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EPHB4P54760 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EPHB4P54760 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EPHB4P54760 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EPHB4P54760 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EPHB4P54760 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EPHB4P54760 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EPHB4P54760 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EPHB4P54760 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EPHB4P54760 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EPHB4P54760 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EPHB4P54760 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
EPHB4P54760 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EPHB4P54760 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EPHB4P54760 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EPHB4P54760 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EPHB4P54760 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EPHB4P54760 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EPHB4P54760 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EPHB4P54760 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EPHB4P54760 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EPHB4P54760 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EPHB4P54760 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EPHB4P54760 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EPHB4P54760 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EPHB4P54760 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EPHB4P54760 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPHB4P54760 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPHB4P54760 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPHB4P54760 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPHB4P54760 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPHB4P54760 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPHB4P54760 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPHB4P54760 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPHB4P54760 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPHB4P54760 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPHB4P54760 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPHB4P54760 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
EPHB4P54760 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPHB4P54760 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPHB4P54760 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPHB4P54760 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPHB4P54760 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
EPHB4P54760 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
EPHB4P54760 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPHB4P54760 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPHB4P54760 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
EPHB4P54760 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPHB4P54760 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPHB4P54760 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPHB4P54760 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPHB4P54760 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPHB4P54760 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
EPHB4P54760 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
EPHB4P54760 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPHB4P54760 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPHB4P54760 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPHB4P54760 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPHB4P54760 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPHB4P54760 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPHB4P54760 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPHB4P54760 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPHB4P54760 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPHB4P54760 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPHB4P54760 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPHB4P54760 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPHB4P54760 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
EPHB4P54760 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
EPHB4P54760 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPHB4P54760 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
EPHB4P54760 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPHB4P54760 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPHB4P54760 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPHB4P54760 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPHB4P54760 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPHB4P54760 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPHB4P54760 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
EPHB4P54760 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPHB4P54760 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPHB4P54760 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPHB4P54760 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPHB4P54760 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms