Protein–RNA interactions for Protein: P53794

SLC5A3, Sodium/myo-inositol cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A3P53794 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC5A3P53794 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC5A3P53794 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC5A3P53794 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC5A3P53794 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC5A3P53794 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC5A3P53794 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC5A3P53794 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC5A3P53794 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC5A3P53794 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC5A3P53794 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC5A3P53794 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC5A3P53794 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC5A3P53794 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC5A3P53794 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC5A3P53794 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC5A3P53794 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC5A3P53794 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC5A3P53794 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC5A3P53794 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC5A3P53794 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC5A3P53794 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms