Protein–RNA interactions for Protein: P53673

CRYBA4, Beta-crystallin A4, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRYBA4P53673 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRYBA4P53673 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRYBA4P53673 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRYBA4P53673 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRYBA4P53673 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRYBA4P53673 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRYBA4P53673 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRYBA4P53673 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRYBA4P53673 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRYBA4P53673 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRYBA4P53673 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRYBA4P53673 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRYBA4P53673 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRYBA4P53673 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRYBA4P53673 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRYBA4P53673 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRYBA4P53673 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRYBA4P53673 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRYBA4P53673 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRYBA4P53673 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRYBA4P53673 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRYBA4P53673 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CRYBA4P53673 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRYBA4P53673 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRYBA4P53673 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRYBA4P53673 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CRYBA4P53673 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CRYBA4P53673 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRYBA4P53673 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRYBA4P53673 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRYBA4P53673 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRYBA4P53673 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRYBA4P53673 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRYBA4P53673 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRYBA4P53673 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRYBA4P53673 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRYBA4P53673 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRYBA4P53673 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRYBA4P53673 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRYBA4P53673 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRYBA4P53673 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRYBA4P53673 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRYBA4P53673 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRYBA4P53673 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRYBA4P53673 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CRYBA4P53673 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRYBA4P53673 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRYBA4P53673 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRYBA4P53673 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRYBA4P53673 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRYBA4P53673 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRYBA4P53673 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRYBA4P53673 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRYBA4P53673 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRYBA4P53673 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CRYBA4P53673 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CRYBA4P53673 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CRYBA4P53673 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CRYBA4P53673 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms