Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARFIP2P53365 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARFIP2P53365 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARFIP2P53365 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARFIP2P53365 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARFIP2P53365 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARFIP2P53365 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARFIP2P53365 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARFIP2P53365 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARFIP2P53365 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARFIP2P53365 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARFIP2P53365 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARFIP2P53365 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARFIP2P53365 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARFIP2P53365 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARFIP2P53365 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARFIP2P53365 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARFIP2P53365 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARFIP2P53365 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARFIP2P53365 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARFIP2P53365 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARFIP2P53365 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARFIP2P53365 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARFIP2P53365 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARFIP2P53365 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARFIP2P53365 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARFIP2P53365 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARFIP2P53365 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARFIP2P53365 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARFIP2P53365 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARFIP2P53365 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARFIP2P53365 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARFIP2P53365 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARFIP2P53365 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARFIP2P53365 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ARFIP2P53365 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARFIP2P53365 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARFIP2P53365 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARFIP2P53365 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARFIP2P53365 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARFIP2P53365 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARFIP2P53365 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARFIP2P53365 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARFIP2P53365 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARFIP2P53365 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARFIP2P53365 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARFIP2P53365 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ARFIP2P53365 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARFIP2P53365 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARFIP2P53365 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ARFIP2P53365 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARFIP2P53365 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARFIP2P53365 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARFIP2P53365 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARFIP2P53365 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARFIP2P53365 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARFIP2P53365 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARFIP2P53365 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARFIP2P53365 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARFIP2P53365 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARFIP2P53365 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARFIP2P53365 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARFIP2P53365 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms