Protein–RNA interactions for Protein: P52790

HK3, Hexokinase-3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HK3P52790 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HK3P52790 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HK3P52790 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HK3P52790 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HK3P52790 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HK3P52790 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HK3P52790 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HK3P52790 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HK3P52790 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HK3P52790 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HK3P52790 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HK3P52790 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HK3P52790 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HK3P52790 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HK3P52790 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HK3P52790 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HK3P52790 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HK3P52790 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HK3P52790 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HK3P52790 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HK3P52790 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HK3P52790 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HK3P52790 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HK3P52790 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HK3P52790 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HK3P52790 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HK3P52790 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HK3P52790 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HK3P52790 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HK3P52790 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HK3P52790 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HK3P52790 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HK3P52790 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HK3P52790 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HK3P52790 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HK3P52790 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HK3P52790 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HK3P52790 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HK3P52790 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HK3P52790 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HK3P52790 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HK3P52790 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HK3P52790 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HK3P52790 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HK3P52790 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HK3P52790 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HK3P52790 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HK3P52790 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HK3P52790 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HK3P52790 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HK3P52790 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HK3P52790 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HK3P52790 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HK3P52790 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HK3P52790 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HK3P52790 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HK3P52790 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HK3P52790 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HK3P52790 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HK3P52790 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HK3P52790 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HK3P52790 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HK3P52790 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HK3P52790 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HK3P52790 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HK3P52790 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HK3P52790 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HK3P52790 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HK3P52790 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HK3P52790 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HK3P52790 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HK3P52790 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HK3P52790 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HK3P52790 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HK3P52790 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HK3P52790 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HK3P52790 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HK3P52790 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HK3P52790 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HK3P52790 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HK3P52790 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HK3P52790 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HK3P52790 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HK3P52790 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HK3P52790 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HK3P52790 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HK3P52790 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HK3P52790 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HK3P52790 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HK3P52790 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HK3P52790 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HK3P52790 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HK3P52790 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HK3P52790 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HK3P52790 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HK3P52790 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HK3P52790 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HK3P52790 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HK3P52790 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HK3P52790 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms