Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BCAMP50895 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BCAMP50895 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BCAMP50895 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BCAMP50895 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
BCAMP50895 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
BCAMP50895 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BCAMP50895 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
BCAMP50895 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
BCAMP50895 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
BCAMP50895 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
BCAMP50895 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BCAMP50895 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
BCAMP50895 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
BCAMP50895 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
BCAMP50895 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BCAMP50895 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
BCAMP50895 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BCAMP50895 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BCAMP50895 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
BCAMP50895 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BCAMP50895 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BCAMP50895 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BCAMP50895 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
BCAMP50895 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
BCAMP50895 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BCAMP50895 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BCAMP50895 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
BCAMP50895 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
BCAMP50895 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
BCAMP50895 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
BCAMP50895 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
BCAMP50895 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
BCAMP50895 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
BCAMP50895 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BCAMP50895 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BCAMP50895 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
BCAMP50895 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BCAMP50895 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BCAMP50895 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BCAMP50895 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BCAMP50895 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BCAMP50895 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BCAMP50895 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BCAMP50895 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BCAMP50895 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BCAMP50895 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BCAMP50895 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BCAMP50895 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
BCAMP50895 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BCAMP50895 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BCAMP50895 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BCAMP50895 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
BCAMP50895 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
BCAMP50895 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
BCAMP50895 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BCAMP50895 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
BCAMP50895 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
BCAMP50895 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BCAMP50895 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
BCAMP50895 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
BCAMP50895 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BCAMP50895 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BCAMP50895 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BCAMP50895 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BCAMP50895 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BCAMP50895 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
BCAMP50895 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
BCAMP50895 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
BCAMP50895 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
BCAMP50895 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BCAMP50895 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BCAMP50895 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BCAMP50895 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
BCAMP50895 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BCAMP50895 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BCAMP50895 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
BCAMP50895 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BCAMP50895 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BCAMP50895 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BCAMP50895 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BCAMP50895 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BCAMP50895 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
BCAMP50895 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
BCAMP50895 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BCAMP50895 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
BCAMP50895 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BCAMP50895 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
BCAMP50895 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
BCAMP50895 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
BCAMP50895 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BCAMP50895 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BCAMP50895 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BCAMP50895 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
BCAMP50895 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
BCAMP50895 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BCAMP50895 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BCAMP50895 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BCAMP50895 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BCAMP50895 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms