Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNNI2P48788 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNNI2P48788 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TNNI2P48788 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNNI2P48788 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNNI2P48788 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNNI2P48788 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNNI2P48788 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNNI2P48788 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNNI2P48788 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNNI2P48788 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNNI2P48788 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNNI2P48788 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNNI2P48788 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNNI2P48788 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TNNI2P48788 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNNI2P48788 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNNI2P48788 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNNI2P48788 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNNI2P48788 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNNI2P48788 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNNI2P48788 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNNI2P48788 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNNI2P48788 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNNI2P48788 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNNI2P48788 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNNI2P48788 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNNI2P48788 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNNI2P48788 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNNI2P48788 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNNI2P48788 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNNI2P48788 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TNNI2P48788 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNNI2P48788 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TNNI2P48788 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TNNI2P48788 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TNNI2P48788 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNNI2P48788 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNNI2P48788 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNNI2P48788 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNNI2P48788 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNNI2P48788 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNNI2P48788 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNNI2P48788 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNNI2P48788 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNNI2P48788 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNNI2P48788 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TNNI2P48788 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNNI2P48788 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNNI2P48788 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNNI2P48788 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNNI2P48788 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNNI2P48788 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNNI2P48788 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNNI2P48788 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TNNI2P48788 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNNI2P48788 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNNI2P48788 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNNI2P48788 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNNI2P48788 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNNI2P48788 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNNI2P48788 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNNI2P48788 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNNI2P48788 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TNNI2P48788 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNNI2P48788 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNNI2P48788 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNNI2P48788 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNNI2P48788 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNNI2P48788 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNNI2P48788 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNNI2P48788 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNNI2P48788 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNNI2P48788 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNNI2P48788 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNNI2P48788 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNNI2P48788 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNNI2P48788 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNNI2P48788 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNNI2P48788 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNNI2P48788 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNNI2P48788 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNNI2P48788 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNNI2P48788 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNNI2P48788 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNNI2P48788 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNNI2P48788 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TNNI2P48788 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TNNI2P48788 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNNI2P48788 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNNI2P48788 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TNNI2P48788 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNNI2P48788 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNNI2P48788 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNNI2P48788 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNNI2P48788 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TNNI2P48788 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNNI2P48788 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNNI2P48788 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNNI2P48788 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms