Protein–RNA interactions for Protein: P48645

NMU, Neuromedin-U, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMUP48645 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMUP48645 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMUP48645 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMUP48645 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMUP48645 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMUP48645 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMUP48645 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMUP48645 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMUP48645 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMUP48645 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMUP48645 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMUP48645 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMUP48645 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMUP48645 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMUP48645 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMUP48645 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMUP48645 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMUP48645 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMUP48645 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMUP48645 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMUP48645 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMUP48645 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMUP48645 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMUP48645 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMUP48645 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMUP48645 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMUP48645 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMUP48645 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMUP48645 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMUP48645 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMUP48645 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMUP48645 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMUP48645 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMUP48645 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMUP48645 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMUP48645 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMUP48645 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMUP48645 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMUP48645 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMUP48645 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMUP48645 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMUP48645 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMUP48645 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMUP48645 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMUP48645 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NMUP48645 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMUP48645 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMUP48645 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMUP48645 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMUP48645 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMUP48645 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMUP48645 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NMUP48645 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMUP48645 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMUP48645 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMUP48645 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMUP48645 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMUP48645 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMUP48645 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMUP48645 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMUP48645 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NMUP48645 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMUP48645 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMUP48645 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMUP48645 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMUP48645 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMUP48645 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMUP48645 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMUP48645 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMUP48645 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMUP48645 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMUP48645 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMUP48645 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMUP48645 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMUP48645 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMUP48645 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMUP48645 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMUP48645 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMUP48645 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMUP48645 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMUP48645 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMUP48645 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMUP48645 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMUP48645 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMUP48645 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NMUP48645 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMUP48645 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMUP48645 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMUP48645 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMUP48645 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMUP48645 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMUP48645 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMUP48645 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMUP48645 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMUP48645 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMUP48645 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMUP48645 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMUP48645 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMUP48645 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMUP48645 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms