Protein–RNA interactions for Protein: P48048

KCNJ1, ATP-sensitive inward rectifier potassium channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNJ1P48048 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNJ1P48048 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNJ1P48048 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNJ1P48048 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNJ1P48048 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNJ1P48048 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNJ1P48048 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNJ1P48048 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNJ1P48048 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNJ1P48048 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNJ1P48048 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNJ1P48048 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNJ1P48048 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNJ1P48048 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNJ1P48048 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNJ1P48048 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNJ1P48048 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNJ1P48048 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNJ1P48048 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNJ1P48048 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNJ1P48048 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNJ1P48048 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNJ1P48048 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNJ1P48048 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNJ1P48048 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNJ1P48048 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNJ1P48048 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNJ1P48048 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNJ1P48048 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNJ1P48048 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNJ1P48048 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNJ1P48048 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNJ1P48048 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNJ1P48048 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNJ1P48048 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNJ1P48048 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNJ1P48048 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNJ1P48048 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNJ1P48048 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNJ1P48048 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNJ1P48048 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNJ1P48048 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNJ1P48048 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNJ1P48048 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNJ1P48048 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNJ1P48048 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNJ1P48048 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNJ1P48048 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNJ1P48048 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNJ1P48048 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNJ1P48048 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNJ1P48048 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNJ1P48048 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNJ1P48048 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNJ1P48048 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNJ1P48048 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNJ1P48048 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNJ1P48048 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNJ1P48048 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNJ1P48048 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNJ1P48048 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNJ1P48048 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNJ1P48048 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNJ1P48048 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNJ1P48048 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNJ1P48048 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNJ1P48048 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNJ1P48048 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNJ1P48048 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNJ1P48048 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNJ1P48048 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KCNJ1P48048 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KCNJ1P48048 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KCNJ1P48048 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNJ1P48048 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNJ1P48048 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNJ1P48048 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNJ1P48048 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNJ1P48048 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNJ1P48048 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNJ1P48048 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNJ1P48048 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNJ1P48048 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNJ1P48048 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNJ1P48048 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNJ1P48048 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNJ1P48048 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNJ1P48048 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNJ1P48048 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNJ1P48048 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNJ1P48048 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNJ1P48048 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNJ1P48048 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNJ1P48048 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNJ1P48048 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNJ1P48048 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNJ1P48048 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNJ1P48048 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNJ1P48048 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNJ1P48048 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms