Protein–RNA interactions for Protein: P46778

RPL21, 60S ribosomal protein L21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL21P46778 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL21P46778 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL21P46778 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL21P46778 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL21P46778 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL21P46778 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL21P46778 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL21P46778 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL21P46778 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL21P46778 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL21P46778 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL21P46778 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL21P46778 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL21P46778 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL21P46778 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL21P46778 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL21P46778 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL21P46778 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL21P46778 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL21P46778 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL21P46778 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL21P46778 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL21P46778 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPL21P46778 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPL21P46778 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPL21P46778 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPL21P46778 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPL21P46778 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPL21P46778 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPL21P46778 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPL21P46778 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPL21P46778 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPL21P46778 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPL21P46778 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPL21P46778 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPL21P46778 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPL21P46778 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL21P46778 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL21P46778 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL21P46778 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL21P46778 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL21P46778 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL21P46778 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL21P46778 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL21P46778 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL21P46778 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL21P46778 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL21P46778 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL21P46778 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL21P46778 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL21P46778 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL21P46778 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL21P46778 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL21P46778 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL21P46778 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL21P46778 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL21P46778 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL21P46778 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL21P46778 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL21P46778 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL21P46778 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL21P46778 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL21P46778 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL21P46778 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL21P46778 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL21P46778 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL21P46778 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL21P46778 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL21P46778 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL21P46778 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL21P46778 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL21P46778 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL21P46778 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL21P46778 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL21P46778 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL21P46778 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL21P46778 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL21P46778 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL21P46778 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL21P46778 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL21P46778 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL21P46778 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL21P46778 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL21P46778 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL21P46778 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL21P46778 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL21P46778 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPL21P46778 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPL21P46778 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPL21P46778 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPL21P46778 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPL21P46778 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPL21P46778 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPL21P46778 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPL21P46778 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPL21P46778 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPL21P46778 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RPL21P46778 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPL21P46778 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RPL21P46778 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms