Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LTBRP36941 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTBRP36941 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTBRP36941 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LTBRP36941 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LTBRP36941 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LTBRP36941 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LTBRP36941 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LTBRP36941 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LTBRP36941 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LTBRP36941 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LTBRP36941 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LTBRP36941 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LTBRP36941 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LTBRP36941 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LTBRP36941 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LTBRP36941 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LTBRP36941 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LTBRP36941 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LTBRP36941 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LTBRP36941 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LTBRP36941 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LTBRP36941 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LTBRP36941 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LTBRP36941 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LTBRP36941 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LTBRP36941 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LTBRP36941 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LTBRP36941 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LTBRP36941 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LTBRP36941 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LTBRP36941 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LTBRP36941 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LTBRP36941 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LTBRP36941 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LTBRP36941 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LTBRP36941 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LTBRP36941 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LTBRP36941 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LTBRP36941 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LTBRP36941 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LTBRP36941 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LTBRP36941 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LTBRP36941 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LTBRP36941 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LTBRP36941 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LTBRP36941 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LTBRP36941 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LTBRP36941 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LTBRP36941 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LTBRP36941 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LTBRP36941 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LTBRP36941 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LTBRP36941 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LTBRP36941 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LTBRP36941 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LTBRP36941 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LTBRP36941 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LTBRP36941 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LTBRP36941 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LTBRP36941 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LTBRP36941 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LTBRP36941 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LTBRP36941 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LTBRP36941 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LTBRP36941 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LTBRP36941 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LTBRP36941 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LTBRP36941 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LTBRP36941 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LTBRP36941 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LTBRP36941 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LTBRP36941 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LTBRP36941 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LTBRP36941 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LTBRP36941 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LTBRP36941 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LTBRP36941 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LTBRP36941 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LTBRP36941 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LTBRP36941 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LTBRP36941 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LTBRP36941 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LTBRP36941 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LTBRP36941 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LTBRP36941 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LTBRP36941 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LTBRP36941 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LTBRP36941 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LTBRP36941 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LTBRP36941 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LTBRP36941 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LTBRP36941 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LTBRP36941 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LTBRP36941 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LTBRP36941 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LTBRP36941 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LTBRP36941 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LTBRP36941 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LTBRP36941 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms