Protein–RNA interactions for Protein: P35443

THBS4, Thrombospondin-4, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS4P35443 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
THBS4P35443 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
THBS4P35443 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
THBS4P35443 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
THBS4P35443 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
THBS4P35443 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
THBS4P35443 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
THBS4P35443 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
THBS4P35443 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
THBS4P35443 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
THBS4P35443 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
THBS4P35443 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
THBS4P35443 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
THBS4P35443 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
THBS4P35443 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
THBS4P35443 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
THBS4P35443 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
THBS4P35443 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
THBS4P35443 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
THBS4P35443 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
THBS4P35443 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
THBS4P35443 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
THBS4P35443 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
THBS4P35443 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
THBS4P35443 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
THBS4P35443 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
THBS4P35443 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
THBS4P35443 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
THBS4P35443 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
THBS4P35443 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
THBS4P35443 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
THBS4P35443 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
THBS4P35443 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
THBS4P35443 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
THBS4P35443 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
THBS4P35443 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
THBS4P35443 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
THBS4P35443 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
THBS4P35443 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
THBS4P35443 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
THBS4P35443 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
THBS4P35443 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
THBS4P35443 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
THBS4P35443 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
THBS4P35443 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
THBS4P35443 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
THBS4P35443 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
THBS4P35443 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
THBS4P35443 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
THBS4P35443 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
THBS4P35443 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
THBS4P35443 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
THBS4P35443 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
THBS4P35443 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
THBS4P35443 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
THBS4P35443 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
THBS4P35443 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
THBS4P35443 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
THBS4P35443 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
THBS4P35443 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
THBS4P35443 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
THBS4P35443 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
THBS4P35443 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
THBS4P35443 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
THBS4P35443 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
THBS4P35443 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
THBS4P35443 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
THBS4P35443 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
THBS4P35443 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
THBS4P35443 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
THBS4P35443 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
THBS4P35443 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
THBS4P35443 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
THBS4P35443 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
THBS4P35443 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
THBS4P35443 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
THBS4P35443 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
THBS4P35443 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
THBS4P35443 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
THBS4P35443 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
THBS4P35443 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
THBS4P35443 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
THBS4P35443 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
THBS4P35443 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
THBS4P35443 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
THBS4P35443 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
THBS4P35443 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
THBS4P35443 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
THBS4P35443 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
THBS4P35443 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
THBS4P35443 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
THBS4P35443 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
THBS4P35443 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
THBS4P35443 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
THBS4P35443 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
THBS4P35443 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
THBS4P35443 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
THBS4P35443 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
THBS4P35443 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
THBS4P35443 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms