Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA4P35212 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA4P35212 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA4P35212 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA4P35212 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA4P35212 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA4P35212 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA4P35212 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA4P35212 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJA4P35212 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJA4P35212 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJA4P35212 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJA4P35212 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJA4P35212 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJA4P35212 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJA4P35212 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJA4P35212 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJA4P35212 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GJA4P35212 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJA4P35212 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GJA4P35212 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJA4P35212 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJA4P35212 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJA4P35212 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GJA4P35212 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GJA4P35212 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJA4P35212 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA4P35212 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA4P35212 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA4P35212 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA4P35212 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA4P35212 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA4P35212 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA4P35212 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA4P35212 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA4P35212 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA4P35212 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA4P35212 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA4P35212 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA4P35212 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA4P35212 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA4P35212 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA4P35212 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA4P35212 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA4P35212 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA4P35212 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA4P35212 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA4P35212 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA4P35212 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA4P35212 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA4P35212 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA4P35212 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA4P35212 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA4P35212 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA4P35212 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA4P35212 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJA4P35212 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJA4P35212 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GJA4P35212 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJA4P35212 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJA4P35212 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJA4P35212 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJA4P35212 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJA4P35212 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJA4P35212 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJA4P35212 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA4P35212 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA4P35212 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA4P35212 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA4P35212 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA4P35212 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA4P35212 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA4P35212 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA4P35212 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA4P35212 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA4P35212 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA4P35212 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA4P35212 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA4P35212 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA4P35212 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA4P35212 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA4P35212 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA4P35212 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA4P35212 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA4P35212 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA4P35212 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJA4P35212 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJA4P35212 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJA4P35212 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJA4P35212 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJA4P35212 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GJA4P35212 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJA4P35212 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJA4P35212 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJA4P35212 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJA4P35212 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GJA4P35212 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJA4P35212 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJA4P35212 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJA4P35212 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms