Protein–RNA interactions for Protein: P32302

CXCR5, C-X-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR5P32302 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXCR5P32302 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXCR5P32302 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXCR5P32302 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXCR5P32302 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXCR5P32302 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXCR5P32302 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXCR5P32302 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXCR5P32302 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CXCR5P32302 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CXCR5P32302 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CXCR5P32302 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CXCR5P32302 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CXCR5P32302 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CXCR5P32302 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CXCR5P32302 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CXCR5P32302 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CXCR5P32302 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CXCR5P32302 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CXCR5P32302 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CXCR5P32302 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CXCR5P32302 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CXCR5P32302 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CXCR5P32302 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CXCR5P32302 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CXCR5P32302 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CXCR5P32302 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CXCR5P32302 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CXCR5P32302 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CXCR5P32302 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CXCR5P32302 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CXCR5P32302 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CXCR5P32302 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CXCR5P32302 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CXCR5P32302 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CXCR5P32302 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CXCR5P32302 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CXCR5P32302 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CXCR5P32302 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXCR5P32302 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXCR5P32302 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXCR5P32302 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXCR5P32302 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXCR5P32302 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXCR5P32302 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXCR5P32302 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXCR5P32302 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXCR5P32302 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXCR5P32302 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXCR5P32302 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXCR5P32302 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXCR5P32302 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXCR5P32302 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCR5P32302 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCR5P32302 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCR5P32302 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCR5P32302 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCR5P32302 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCR5P32302 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCR5P32302 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCR5P32302 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCR5P32302 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCR5P32302 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCR5P32302 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCR5P32302 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCR5P32302 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCR5P32302 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCR5P32302 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCR5P32302 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCR5P32302 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCR5P32302 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCR5P32302 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCR5P32302 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCR5P32302 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCR5P32302 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCR5P32302 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCR5P32302 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCR5P32302 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCR5P32302 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCR5P32302 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCR5P32302 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCR5P32302 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCR5P32302 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCR5P32302 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCR5P32302 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCR5P32302 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCR5P32302 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCR5P32302 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXCR5P32302 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXCR5P32302 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXCR5P32302 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXCR5P32302 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXCR5P32302 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXCR5P32302 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXCR5P32302 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXCR5P32302 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXCR5P32302 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXCR5P32302 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXCR5P32302 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXCR5P32302 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms